学历

博士

职称

副教授

所属部门

生物技术系

招生专业

细胞生物学（学硕，计算生物学），生物与医药（专硕）

im体育

E-mail: xryang##ctienviron.com(##用@代替）

个人简介

 杨雪蓉，女，博士，副教授。2007年和2014年先后在四川农业大学获得学士和博士学位；2011年11月至2013年5月在美国Iowa State University进行博士联合培养，主要从事分子遗传与生物信息学研究。2015年1月至2016年11月到中国科学院上海im体育研究院计算生物学研究所从事博士后研究，利用细胞与分子生物学及计算生物学技术进行RNA可变剪接与癌症方面的研究工作。2016年11月至今在im体育农业大学im体育工作。2019 年 12 月至 2020 年 12 月在美国 University of Nebraska-Lincoln做访问学者。主要从事杂种优势利用、癌症可变剪切与计算生物学方面的研究，主持国家自然科学基金青年项目一项，中国博士后科学基金面上项目一项，同时参与国家自然科学基金面上项目等课题，以第一作者或共同作者在 Plant Biotechnology Journal、Communications Biology、PLoS ONE、BMC Plant Biology、Genomics、BMC Genomics、Nature等杂志发表SCI文章多篇，担任Frontiers in plant sciences、BMC genomics等期刊审稿人。

教学工作

    承担本科生《im体育》课程的教学工作。

研究方向

1. 肿瘤损伤修复与癌症可变剪切方向：利用基因组/外显子组/转录组/蛋白质等多组学技术手段，模拟整合现有统计模型和算法，展开系统的研究和探索，揭示癌症发展中的关键分子标志物和潜在的治疗靶点。

2. 大数据和人工智能方向：利用人工智能模型和大数据分析，特别是在个体化医疗和精准医疗的背景下。通过深入理解肿瘤生物学的复杂性，探索新的治疗策略。

非常欢迎具有数学、统计和编程能力的同学报考本实验室研究生。

科研项目

1、国家自然科学基金委员会，青年项目，玉米褐色叶脉突变体Brown Midrib 6 (bm6)的图位克隆和功能解析（32101705），2022 - 2024，主持

2、生物信息学平台数据分析（381538），横向项目，2022-2024，主持

3、中国博士后科学基金会，面上项目，CLK1在细胞分裂中的剪接调控功能及其对癌症进程的影响(2015M571612)，2015-2017，主持

4、国家自然科学基金委员会，面上项目, 玉米百粒重主效QTL（Hgw1q1）克隆及分子机理解析（32072009），2021 - 2024，参加

5、国家自然科学基金委员会，面上项目，玉米醇溶蛋白基因染色体重排和拷贝数变化的遗传解析（31771799），2018 - 2021，参加

6、im体育自然科学基金委员会，面上项目：玉米褐色叶中脉突变体基因家族调控网络和品质性状遗传改良（ZR2017MC017），2017-2020，参加

7、im体育农业大学双一流建设优势创新团队：玉米突变体库构建与重要农艺性状基因鉴定及应用（564043），2017-2020，参加

发表论文

1. Huang Y†, Wang H†, Zhu Y†, Huang X, ......, Wang J, Yang X, Liu H, Lu X, Larkins B.A., Wang W* & Wu W*. THP9 enhances seed protein content and nitrogen-use efficiency in maize. Nature, 2022, 612(7939):292-300.

2. Liu H†, Wang Q†, Chen M, Ding Y, Yang X, ...... Lai J, Zhang X* and Huang X*. Genome-wide identification and analysis of heterotic loci in three maize hybrids. Plant Biotechnology Journal, 2020, 18(1):185–194.

3. Liu H†, Huang Y†, Li X†,……, Yang X, Huang X, Yuan L, An D, Wang W, Holding D.R. and Wu Y*. High frequency DNA rearrangement at qγ27 creates a novel allele for Quality Protein Maize breeding. Communications Biology, 2019, 2: 460.

4. Liu H#, Ma L#, Yang X#, Zuo T, Zhang L, Zeng X, Peng H, Pan G, Wu Y, Shen Y: Integrative analyses of DNA methylation, mRNA, and small RNA during dedifferentiation of maize embryo. BMC plant biology 2017, 17(1):105. (#co-first)

5. Wei HH, Liu Y, Wang Y, Lu Q, Yang X, Li J, Wang Z. Engineering Artificial Factors to Specifically Manipulate Alternative Splicing in Human Cells. J. Vis. Exp., 2017, 122.

6. Yang X#, Koltes JE#, Park CA, Chen D, Reecy JM. Gene co-expression network analysis provides novel insights into myostatin regulation at three different mouse developmental timepoints. PLoS One. 2015, 10(2): e0117607.

7. Yang X, Yu B, Mao XB, Zheng P, He J, Yu J, He Y, Reecy JM, Chen DW. Lean and obese pig breeds exhibit differences in prenatal gene expression profiles of muscle development. Animal. 2015, 9(1): 28-34.

8. Liu H#, Yang X#, Liao X#, Zuo T, Qin C, Cao S, Dong L, Zhou H, Zhang Y, Liu S, Shen Y, Lin H, Lübberstedt T, Zhang Z, Pan G. Genome-wide comparative analysis of digital gene expression tag profiles during maize ear development. Genomics. 2015, 106(1): 52-60. (#co-first)

9. Liu H, Qin C, Chen Z, Zuo T, Yang X, Zhou H, Xu M, Cao S, Shen Y, Lin H, He X, Zhang Y, Li L, Ding H, Lübberstedt T, Zhang Z, Pan G. Identification of miRNAs and their target genes in developing maize ears by combined small RNA and degradome sequencing. BMC genomics2014, 15:25.

10. Lei H, Yu B, Huang Z, Yang X, Liu Z, Mao X, Tian G, He J, Han G, Chen H, Mao Q, Chen D. Comparative analysis of mesenchymal stem cells from adult mouse adipose, muscle, and fetal muscle. Mol Biol Rep. 2013, 40(2): 885-892.

11. Lei H, Yu B, Yang X, Liu Z, Huang Z, Mao X, Tian G, He J, Han G, Chen H, Mao Q, Chen D. Inhibition of adipogenic differentiation by myostatin is alleviated by arginine supplementation in porcine-muscle-derived mesenchymal stem cells. Sci China Life Sci. 2011, 54(10): 908-916.